本篇内容介绍了“怎么用r语言统计相同id出现的频率”的有关知识,在实际案例的操作过程中,不少人都会遇到这样的困境,接下来就让小编带领大家学习一下如何处理这些情况吧!希望大家仔细阅读,能够学有所成!
r语言代码,统计向量的频次,其实很简单,用table方法一步就完成,后面就是绘图了:
注意本代码的主题为cowplot主题适合sci文章发表,并设置了柱状图上加数字。
library(reshape2) local({r <- getoption("repos") ;r["cran"] <- "http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/cran/" ;options(repos=r)}) library(ggplot2) library(cowplot) library(rcolorbrewer) pairjoin <- function(x){ ran=x ran[length(ran)]=">=11" ran=ran[-1] ran } #统计频率,并把大于11的 归类到一起: data=table(data) data[data>10]=11 massstatn <- with(hist(data, breaks=seq(0, 11, by = 1), plot=false), data.frame(n=counts, mass=pairjoin(breaks), pct=counts/sum(counts))) massstatn massstatn$mass=factor(massstatn$mass,levels = massstatn$mass,order=t) pn=ggplot(data=massstatn, aes(x=mass, y=n)) geom_bar(fill="#4daf4a",alpha = .9, stat="identity",width=0.8) geom_text(aes(x=mass,y=n 20,label=n)) guides(fill=false) theme(legend.key = element_blank(),legend.title = element_blank() ) xlab("peptide number") ylab("protein number") ggtitle("peptide number distribution") pn
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